Udowodniono, że w 90% przypadków ZA ma podłoże genetyczne (dziedziczenie). W pozostałych przypadkach zdarzają się:
- Uszkodzenia okołoporodowe,
- Toksoplazmoza,
- Zatrucia w czasie ciąży,
- Infekcje w czasie ciąży (opryszczka, ospa wietrzna),
- Spontaniczne mutacje.
W części przypadków nie umiemy znaleźć przyczyny.